SENP6

SENP6
Ідентифікатори
Символи	SENP6, SSP1, SUSP1, SUMO1/sentrin specific peptidase 6, SUMO specific peptidase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605003 MGI: 1922075 HomoloGene: 9196 GeneCards: SENP6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity; • cysteine-type peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • SUMO-specific endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • цитоплазма;
Біологічний процес	• protein desumoylation; • protein modification by small protein removal; • regulation of spindle assembly; • protein sumoylation; • протеоліз; • regulation of kinetochore assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	26054
	215351
	ENSG00000112701
	ENSMUSG00000034252
	Q9GZR1
	Q6P7W0
	NM_001100409; NM_001304792; NM_015571
	NM_146003; NM_001311110
	NP_001093879; NP_001291721; NP_056386
	NP_001298039; NP_666115
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SENP6 (англ. SUMO1/sentrin specific peptidase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 112 амінокислот, а молекулярна маса — 126 146^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGKSGGSA	GEITFLEALA	RSESKRDGGF	KNNWSFDHEE	ESEGDTDKDG
TNLLSVDEDE	DSETSKGKKL	NRRSEIVANS	SGEFILKTYV	RRNKSESFKT
LKGNPIGLNM	LSNNKKLSEN	TQNTSLCSGT	VVHGRRFHHA	HAQIPVVKTA
AQSSLDRKER	KEYPPHVQKV	EINPVRLSRL	QGVERIMKKT	EESESQVEPE
IKRKVQQKRH	CSTYQPTPPL	SPASKKCLTH	LEDLQRNCRQ	AITLNESTGP
LLRTSIHQNS	GGQKSQNTGL	TTKKFYGNNV	EKVPIDIIVN	CDDSKHTYLQ
TNGKVILPGA	KIPKITNLKE	RKTSLSDLND	PIILSSDDDD	DNDRTNRRES
ISPQPADSAC	SSPAPSTGKV	EAALNENTCR	AERELRSIPE	DSELNTVTLP
RKARMKDQFG	NSIINTPLKR	RKVFSQEPPD	ALALSCQSSF	DSVILNCRSI
RVGTLFRLLI	EPVIFCLDFI	KIQLDEPDHD	PVEIILNTSD	LTKCEWCNVR
KLPVVFLQAI	PAVYQKLSIQ	LQMNKEDKVW	NDCKGVNKLT	NLEEQYIILI
FQNGLDPPAN	MVFESIINEI	GIKNNISNFF	AKIPFEEANG	RLVACTRTYE
ESIKGSCGQK	ENKIKTVSFE	SKIQLRSKQE	FQFFDEEEET	GENHTIFIGP
VEKLIVYPPP	PAKGGISVTN	EDLHCLNEGE	FLNDVIIDFY	LKYLVLEKLK
KEDADRIHIF	SSFFYKRLNQ	RERRNHETTN	LSIQQKRHGR	VKTWTRHVDI
FEKDFIFVPL	NEAAHWFLAV	VCFPGLEKPK	YEPNPHYHEN	AVIQKCSTVE
DSCISSSASE	MESCSQNSSA	KPVIKKMLNK	KHCIAVIDSN	PGQEESDPRY
KRNICSVKYS	VKKINHTASE	NEEFNKGEST	SQKVADRTKS	ENGLQNESLS
STHHTDGLSK	IRLNYSDESP	EAGKMLEDEL	VDFSEDQDNQ	DDSSDDGFLA
DDNCSSEIGQ	WHLKPTICKQ	PCILLMDSLR	GPSRSNVVKI	LREYLEVEWE
VKKGSKRSFS	KDVMKGSNPK	VPQQNNFSDC	GVYVLQYVES	FFENPILSFE
LPMNLANWFP	PPRMRTKREE	IRNIILKLQE	DQSKEKRKHK	DTYSTEAPLG
EGTEQYVNSI	SD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Yeh E.T.H., Gong L., Kamitani T. (2000). Ubiquitin-like proteins: new wines in new bottles. Gene. 248: 1—14. PMID 10806345 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00139-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lima C.D., Reverter D. (2008). Structure of the human SENP7 catalytic domain and poly-SUMO deconjugation activities for SENP6 and SENP7. J. Biol. Chem. 283: 32045—32055. PMID 18799455 DOI:10.1074/jbc.M805655200
Mukhopadhyay D., Arnaoutov A., Dasso M. (2010). The SUMO protease SENP6 is essential for inner kinetochore assembly. J. Cell Biol. 188: 681—692. PMID 20212317 DOI:10.1083/jcb.200909008
Dou H., Huang C., Singh M., Carpenter P.B., Yeh E.T. (2010). Regulation of DNA repair through desumoylation and sumoylation of replication protein A complex. Mol. Cell. 39: 333—345. PMID 20705237 DOI:10.1016/j.molcel.2010.07.021
Hattersley N., Shen L., Jaffray E.G., Hay R.T. (2011). The SUMO protease SENP6 is a direct regulator of PML nuclear bodies. Mol. Biol. Cell. 22: 78—90. PMID 21148299 DOI:10.1091/mbc.E10-06-0504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20944 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9GZR1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 січня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20944 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9GZR1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 січня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]