We are excited to share that Mateusz Sikora, Polonium Foundation alumnus, received mobility financing from NAWA - Polish National Agency for Academic Exchange and German Academic Exchange Service (DAAD)! Matt experienced first-hand how international experiences enrich science and how collaborations are key to progress. In the same time, Matt returned to Poland to continue his scientific career here, giving an excellent example of turning brain drain into brain circulation. Congratulations Matt!
Narodowa Agencja Wymiany Akademickiej ogłosiła wyniki naboru na wspólne projekty badawcze prowadzone pomiędzy Polską a Niemcami. Celem konkursu, który prowadzony jest wraz z Niemiecką Centralą Wymiany Akademickiej (Deutscher Akademischer Austauschdienst, DAAD) jest wsparcie mobilności naukowców realizujących projekty badawcze. Jednym z dziesięciu tegorocznych beneficjentów programu jest dr Mateusz Sikora z Małopolskiego Centrum Biotechnologii UJ. Zespół dr. Mateusza Sikory wspólnie z naukowcami z Uniwersytetu w Bremie realizować będzie projekt pt. "Symulacje dynamiki molekularnej białek z modyfikacjami glikanowymi w gęstych środowiskach komórkowych: Wpływ nowotworowych glikanów na adhezję komórek". Większość białek pozakomórkowych jest glikozylowana, a glikany tworzą wokół białek dynamiczne osłony, które redukują interakcje białko-białko. Jednak ze względu na sposób ich ułożenia nadal umożliwiają one występowanie pewnych natywnych interakcji. Jest to szczególnie ważne w przypadku białek adhezji komórkowej, takich jak kadheryny, które tworzą odrębne, gęste zespoły, aby zapewnić silne interakcje w układzie komórka-komórka. Pomimo tak dużej gęstości, te kadheryny są silnie glikozylowane. W nowotworach stan glikozylacji białek zmienia się, a duże, bardziej rozgałęzione glikany stają się powszechne. Zasugerowano, że te duże glikany wpływają na upakowanie adhezji i zakłócają je, co prowadzi do przerzutów nowotworowych. Jak dotąd wpływ glikanów na upakowanie kadheryn i interakcje białek jest słabo poznany. Naukowcy z UJ, wykorzystując swoje doświadczenie w symulowaniu dużych kompleksów glikoproteinowych i opisywaniu dynamiki glikanów, przeprowadzą symulacje MD (dynamika molekularna) na dużą skalę. Zbadane zostaną gęste roztwory domen kadheryn zarówno bez glikanów, jak i z różnymi typami glikozylacji. Analizując dyfuzję białek, lepkość, wymianę kontaktów i interakcje w różnych warunkach i gęstościach, będą się starać zrozumieć, w jaki sposób glikany wpływają na adhezje i przyczyniają się do przerzutów. Projekt badawczy dostarczy pierwszego ilościowego opisu wpływu glikanów na interakcje białek, z potencjalnymi implikacjami dla opracowywania terapii ukierunkowanych na przerzuty poprzez zmianę wzorców glikozylacji. Dr Mateusz Sikora jest kierownikiem działającego w Małopolskim Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego Centrum Dioscuri do Modelowania Modyfikacji Posttranslacyjnych. Studiował najpierw na UJ, a następnie doktoryzował się w Instytucie Fizyki Polskiej Akademii Nauk w Warszawie. W 2012 r. wyjechał do Austrii i rozpoczął staż podoktorski w Instytucie Nauki i Technologii (IST Austria). Od 2017 r. pracuje w Instytucie Biofizyki im. Maxa Plancka w grupie Gerharda Hummera. Powrócił do Polski w marcu 2023 r., aby kontynuować swoje badania i karierę naukową, dzięki polsko-niemieckiemu wsparciu finansowemu udzielonemu w ramach programu Dioscuri przez Towarzystwo Maxa Plancka i Narodowe Centrum Nauki. fot. Katarzyna Wrona